Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik1Q60934 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik1Q60934 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms