Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms