Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms