Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samhd1Q60710 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms