Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PmelQ60696 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms