Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scaf1Q5U4C3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms