Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc42Q5SV66 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms