Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sco1Q5SUC9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms