Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp18Q5SSI6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp18Q5SSI6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp18Q5SSI6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms