Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rapgef6Q5NCJ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rapgef6Q5NCJ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms