Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SynaQ5G5D5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SynaQ5G5D5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms