Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grhl3Q5FWH3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grhl3Q5FWH3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms