Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chsy3Q5DTK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chsy3Q5DTK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms