Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms