Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms