Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a2Q3ZAS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a2Q3ZAS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a2Q3ZAS0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms