Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc110Q3V125 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms