Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms