Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TceancQ3US16 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TceancQ3US16 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms