Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UPC7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms