Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smu1Q3UKJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms