Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp19Q3UJD6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms