Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edc4Q3UJB9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edc4Q3UJB9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edc4Q3UJB9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms