Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U6N9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U6N9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms