Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms