Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms