Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q3TTL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3TTL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms