Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms