Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calr4Q3TQS0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms