Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smarca4Q3TKT4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Smarca4Q3TKT4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms