Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms