Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms