Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms