Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms