Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Perm1Q149B8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Perm1Q149B8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Perm1Q149B8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Perm1Q149B8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Perm1Q149B8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Perm1Q149B8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Perm1Q149B8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Perm1Q149B8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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