Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms