Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab42Q0PD08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms