Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrioQ0KL02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms