Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cass4Q08EC4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms