Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms