Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MestQ07646 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MestQ07646 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MestQ07646 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MestQ07646 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms