Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp2Q06649 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms