Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcr5Q04683 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms