Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp39Q02525 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp39Q02525 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms