Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl1Q02067 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms