Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SelpQ01102 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelpQ01102 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms