Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms