Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Il6stQ00560 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il6stQ00560 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms