Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms