Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b3P97370 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b3P97370 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms